Installation Bioperl: IO::String

Installation Bioperl: IO::String - Perl - Programmation

Marsh Posté le 19-05-2005 à 11:40:39    

Bonjour à tous.
Je suis sous mandrake 10, et j'essaie d'installer Bioperl1.5.0
A la premiere étape de l'installation: perl Makefile.pl tout se passe bien, mais lorsque je fais le make, voila se qu'il m'affiche:
 

Code :
  1. Warning: prerequisite IO::String 0 not found.


 
J'ai donc cherché sur le net IO::String, que j'ai trouvé ici:
http://search.cpan.org/dist/IO-String/String.pm
Lors de son installation, je fais egalement un Makefile.pl, qui semble marcher, mais lors du make voila un autre probleme:
make: *** Pas de règle pour fa [...]  ». Arrêt.
Maintenant je ne sais pas quoi faire.
Je souligne que je suis en route pour ces manip, et que je possède la version 5.8.3 de perl.
 
J'ai besoin d'aide, merci d'avance!!
 :hello:

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Marsh Posté le 19-05-2005 à 11:40:39   

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Marsh Posté le 19-05-2005 à 11:59:41    

comme le moduel est uniquement en perl tu peux le copier directement, à la main:
met String.pm dans ton lib, dans un repertoir IO
 
genre: /usr/lib/perl5/site_perl/5.8.3/IO/String.pm

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Marsh Posté le 19-05-2005 à 13:44:02    

Merci pospos pour ta réponse. J'ai donc effectué cette copie. Lorsque j'ai donc refais mon Makefile, tout c'est bien passé, plus de problème avec IO::String. Par contre, lorsque je fais make , j'ai le même probleme que j'ai eu avec la make de l'installation de IO::STring.

Code :
  1. make: *** Pas de règle pour fabriquer la cible « /usr/lib/perl5/5.8.3/i386-linux-thread-multi/CORE/config.h », nécessaire pour « Makefile ». Arrêt.


Tu sais d'ou ça peut venir?
Merci  :jap:

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Marsh Posté le 19-05-2005 à 13:53:13    

ha ben la c'est ta distrib qui doit chier dans la colle...
t'as pas de problemes pour compiler d'autres trucs?
T'as pas fais des manips foireuses avec ton install de Perl ou autre?

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Marsh Posté le 19-05-2005 à 14:04:47    

ben je ne vois pas. Je lance des scripts perl que je crée moi même sans problème, jai fait quelques mises à jours de perl via l'interface de la mandrake... mais c'est tout.
Comment faire?

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Marsh Posté le 19-05-2005 à 14:23:50    

essai peut etre de virer ton perl et d'en réinstaller un propre (par exemple ActivePerl), en oubliant les mises à jour automatiques de mandrake (ya ppm pour ca dans activeperl, et ya aussi cpanplus qui marche tres bien)

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Marsh Posté le 19-05-2005 à 14:27:33    

Bon ben voila, en plaçant le config.h d'un autre ordi dans ce rep ça marche... Des fois il ne fait pas chercher à comprendre...
Merci  :hello:

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Marsh Posté le 19-05-2005 à 14:37:36    

Tant mieux. Mais bon c'est pas tres bon signe tout de meme, tu risque d'avoir d'autres problemes...
Mieux vaut réinstaller maintenant que d'attendre d'avoir installé pleins de modules et de devoir tout refaire.

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